在保护区核心区，我们协助保护区工作人员分别在原生林和次生林（样地1）进行了样方调查。原始林乔木层物种数为6，次生林乔木层物种数为7，仅从物种丰富度来考虑，是次生林物种较为丰富。
该次生林具有两个显著特点：首先，糙皮桦在乔木层中所占比例非常大，是绝对的建群种。第二，次生林中乔木胸径明显偏小而植株密度大，样地内植株数量是原始林样地的3-4倍。择伐后次生林的乔木层多样性比原生林高，这与Connell等人提出的中度干扰假说相符。
3）人工造林成功的森林内部多样性低
建立保护区前，核心区的某些地区是人工林场，人工营林的树种为华北落叶松，乔木层为落叶松纯林，存在着小蠹等病虫害的威胁。
4）退耕还林林地的植被多样性
人工营林的一般步骤是皆伐乔木，随后清除林内所有灌木和草本植物。种植乔木后必须连续抚育3年，清理次生灌木，使乔木生长不受灌木的妨碍。退耕还林不需要进行皆伐，但清灌仍是必须的。但在白水江，通过入户访谈我们得知，当地居民种植华北落叶松后并不进行任何管理；而我们在退耕的林地看到，种植了3年的华北落叶松生长情况很差，被大量的蕨类植物所淹没，离预期的生态效应有很大差距。耕作—退耕还林—疏于管理的后果是使坡顶的植被退化成次生灌丛或草地。
2.4 对大熊猫保护和驯养状况的了解
从保护生物学来看，大熊猫既是关键种、稀有种，又是伞护种。把保护大熊猫当作重点，意义不仅在于保护“国宝”，更在于保护整个生态系统的功能。
秦岭南坡中山夷平面上有5个植被茂密的“山岛”，摩天岭就是其中最靠西的一个。大熊猫就在这种列岛状、具有残遗性的环境中栖息。
在对保护区管理局的专家进行访谈时我们得知，卧龙、唐家河等保护区多年来旅游开发强度大，对大熊猫的生存造成了干扰，而白水江自然保护区旅游开发至今还处于试探阶段，但大熊猫的保护颇见成效，野外大熊猫的数量呈增加趋势。目前，保护区野外的大熊猫遇到危险都是送至文县的保护区管理局救治。保护区希望能够在技术条件成熟后，在离大熊猫栖息地最近的邱家坝大熊猫驯养中心进行救治。但建立所谓驯养中心的意义仅在于救助，靠加强人工驯养来增加大熊猫数量而不支援其野外种群的方法是不可取的。
3 农业生态系统
在我们考察的白马河保护站，社区、农田主要分布在靠近河谷的地区，公路也依河而建。一方面，虽然按照保护区的相关法律，保护区内不允许进行农业生产，但白水江在70年代是采伐林场，众多人口的生存压力下，农业开发是人们不得已的选择。另一方面，河两侧的山地高寒、土地贫瘠、土层薄，一旦进行人工种植必然水土流失严重，人类无法长期在那种环境中生存，只能在河谷地带久居。
3.1 农田生态
由于特殊的地理条件所限制，自然保护区内交通不便，封闭性强，人类活动的基本目的仍停留在温饱自足阶段，经济主要依赖于农业，第二三产业严重滞后。这也造成了当地人在经济发展的压力下，无暇考虑生态的因素，从而有一些不得已的违背生态保护的行为，可以说这是白水江三农问题的一个主要特点。农业生产以粮为主，畜牧业、林果业、渔业长期处于从属地位，是一种靠天吃饭的生产方式。
（1）主要种植农作物
白水江所处的地区是亚热带向暖温带过渡的地区，湿润多雨，土壤微酸性，虽然当地水资源丰富，但却多在深山大沟之中难以利用，水浇地只占全部耕地的2%。由此决定了当地的农作物主要以小麦、玉米为主，这也可以从当地的饮食结构得到验证：主要以小麦面和玉米面为主，大米食用很少；此外种植了一些荞麦、油菜、向日葵等作物；在海拔较高的地区，还种有一些耐贫瘠的花椒；在自家的院前院后也种植有一些果树但主要是自己食用。
从上述的资料来看，当地的农业仍然是以满足当地人基本温饱问题为目的的，即使有一些果树或者经济作物，也很少有深加工的商品化生产。在入户调查中，当地人也想过农产品加工的方法来摆脱贫困的现状，但阻碍他们这样做的主要有两个原因：一是不便的交通，当地仍没有一条柏油马路，晴天时已是难以通行，雨天时则是完全不能行走，有时还会出现泥石流；二是资金的匮乏，当地农民手中没有余款，当地政府的投资也是杯水车薪。这样一种状况导致了外来投资不愿进，当地产品运不出。对生态影响较小的商品农业无法实现。
（2）农田地形与合理套种
出于生存的本能，当地人民不得不大量的开荒来满足越来越多的新增人口的粮食需要。调查的过程中，经常可以看到在青山上有一片一片的荒地，即是耕种着或耕种后废弃不用的土地，农田和草地代替了灌木丛，水土保持的功效几乎完全丧失。
